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實驗室目前的核心研究聚焦於自然環境中的酵母菌，特別是以多物種（multi-species）、多族群（multi-population）的架構，結合族群基因體學、多體學與自動化表型分析，探索酵母在自然界中的演化、適應與生態分化。

現行多數族群基因體學研究多集中於單一物種；然而，若要真正理解演化過程中的共通規律與物種差異，必須將多個酵母物種、各自多個族群，放在相同地理與環境背景下進行比較。我們希望建立這樣一個具比較深度與解析力的研究架構，去回答更基本、也更困難的演化問題。

目前實驗室結合野外採樣、基因體定序、自動化表型分析與多體學整合，已累積超過 3000 株酵母菌株，並持續建立亞洲尺度的 yeast evolutionary genomics 資源。

我們想回答的問題：
1. 台灣對酵母菌而言，扮演的是什麼樣的演化角色？
2. 不同酵母物種在相似環境下，是否會出現平行演化？
3. 自然選擇主要作用在基因體、轉錄體，還是代謝層級？
4. 不同酵母物種之間的適應模式，哪些是共通的，哪些是各自獨特的？
5. 多物種、多體學與表型資料能否一起幫助我們更準確理解自然界中的演化機制？

研究技術與資源
實驗室研究結合：
• 野外酵母採樣與菌株分離
• 基因體定序與族群基因體分析
• 自動化高通量表型分析
• transcriptomics、metabolomics 等多體學整合
• 長讀定序與生物資訊分析

我們希望把酵母研究從單一物種、單一尺度的分析，推向多物種、多層次整合的比較框架。

我們期待你：
• 對自然界中的酵母演化有真正的好奇心
• 願意學習新技術，也願意跨尺度整合不同資料
• 具良好溝通能力，樂於討論與合作
• 對研究紀錄、資料整理與分析保持嚴謹
• 具基因體學、生物資訊、微生物培養、分生實驗、表型分析或多體學相關經驗者佳，但非必須

(1)負責熱危害與健康調適研究計畫執行及管理。
(2)支援環境健康微型感測器或空氣品質觀測相關研究活動。

主要工作為執行國科會及其他相關研究計畫，研究主軸聚焦於新興環境污染物暴露及早期健康效應指標(如氧化傷害壓力)對於易受傷害族群(例如母親及胎兒)的潛在健康風險之相關研究。透過開發尖端分析平台，深入探討氣候變遷下的主要環境因子與疾病機制的關聯，並尋求健康促進之介入調適。

具體工作項目如下：
1. 可獨立操作HPLC、LC/MS/MS、GC/MS/MS等儀器
2. 人體生物檢體（如尿液、血液等）中生物指標之分析方法開發與優化
3. 分析流行病學資料，整合環境暴露數據與健康效應結果
4. 計畫管理、研究報告論文撰寫與投稿國際學術期刊
5. 支援環境健康微型感測器之相關研究活動
6. 完成主管交辦的其他研究相關事項

生態系統服務評估研究

1. 資料探勘與深度學習/大語言模型、多媒體社群網路與通訊網路、應用數學應用相關研究。
2. 或者具備演算法設計、圖論、最佳化、賽局理論、機器學習、深度學習、統計推論、隨機程序相關背景愛好數學。
3. 實作深度學習模型、大型語言模型等，收集資料集並進行以上模型實驗。
4. 或者有興趣網路或巨量資料分析系統實作、程式撰寫適合擬專心研究論文撰寫，未來從事學術工作者。

大氣雲模式及降水粒子運動數值模擬與分析
Perform numerical simulation and analysis of atmospheric cloud model and precipitation particle motions.

1. 主要進行合成生物學研究與代謝體分析，結合基因體學、轉錄體學、蛋白質體學、及AI輔助，研究植物固碳或增加其生產量的調控分子、代謝途徑、或促進生長素。運用分子生物學技術與生化實驗分析，了解合成途徑或特定分子對植物或藍綠菌的生理及生化影響，進一步提出新法以促進光合效率固碳與增加產量。
Studying synthetic biology and metabolomic analyses by combining multi-omics and AI-assisted analysis to explore factors with potential for enhancing plant carbon fixation and productivity. By molecular biology and biochemical experiments, we examine the effects of synthetic pathways and specific molecules on plants and cyanobacteria, contributing to research on improving photosynthetic efficiency and yield.
2. 實驗室日常工作，包含藥品配製，細菌培養，植物種植管理，採購報帳，安全衛生管理。Routine laboratory work, including reagent preparation, bacterial culture, plant cultivation and management, purchasing and reimbursement, and safety and sanitation management.

【細菌演化基因體學研究】以⽣物資訊學⼯具進⾏⼤規模序列⽐較，探討不同細菌的遺傳多樣性及物種分化。重點包括探究物種界定⽅法，以改善分類架構與鑑定準確度，並進⼀步檢視與物種分化相關的關鍵基因，提供演化與功能基因體學的新⾒解。相關研究主題及近期發表請⾒實驗室網站： https://ipmb.sinica.edu.tw/chkuo/

奈米生物光學實驗室(NanoBioPhotonics Lab, NBP Lab)致力於開發先進光學顯微技術，結合化學與生物技術，透過跨領域方法，定量探討活細胞中奈米尺度結構與動態。工作內容包光學顯微鏡系統開發與優化、活細胞實驗、影像數據分析、研究計畫執行及論文發表。

我們致力於了解在組織屏障中，免疫調控對於維持生理恆定或是誘發疾病的影響以及其所扮演的角色。研究主題目前有三個主要方向: 1. 運用小鼠模式探討B細胞的免疫耐受性在腦膜產生的機制以及腦膜B細胞在中樞神經系統免疫疾病如多發性硬化症中所扮演的角色。2. 運用小鼠模式了解嗜酸性白血球如何維持腸道恆定及影響腸道發炎。3. 運用小鼠模式了解非編碼RNA如何調控第三型先天性免疫淋巴球，進而維持腸道恆定及影響腸道發炎。有興趣的申請者歡迎來信討論工作內容！

1. 協助進行大型人體生物資料庫遺傳學研究，如Taiwan Biobank, TPMI, UK Biobank。

2. 進行轉錄體(RNA-seq) 及其他多體學分析研究。

3. 其他臨時交辦事務

助理工作內容：
1. 提升植物氮肥利用效率之應用
2. 全方位研發植物硝酸鹽轉運蛋白功能

我們實驗室主要是以植物為研究材料(包含阿拉伯芥及水稻)，探討營養運送及訊息傳導途徑與機制，現有的研究成果卓越，在國際頗受重視且屢次改寫教科書，植物對氮源的吸收與人類的糧食息息相關，我們的研究主題可以往應用發展提高作物的氮肥利用效率，改善糧食產量並降低環境污染；也可往基礎研究發展。
這兒是一個歡樂蔡市場，也是升博班的好跳板，我們有完整的研究系統、非常充足的資源。歡迎喜歡研究工作的你，加入我們的行列。

博士後工作內容：
1. 提升植物氮肥利用效率之應用
2. 全方位研發植物硝酸鹽轉運蛋白功能

我們實驗室主要是以植物為研究材料(包含阿拉伯芥及水稻)，探討營養運送及訊息傳導途徑與機制，現有的研究成果卓越，在國際頗受重視且屢次改寫教科書，植物對氮源的吸收與人類的糧食息息相關，我們的研究主題可以往應用發展提高作物的氮肥利用效率，改善糧食產量並降低環境污染；也可往基礎研究發展。
這兒是一個歡樂蔡市場，也是找教職的好跳板，我們有完整的研究系統、非常充足的資源。歡迎喜歡研究工作的你，加入我們的行列。