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在細胞分裂前必須先複製DNA，但同一時間，許多基因也正在被轉錄。當DNA複製機器與轉錄機器在同一段基因體上相遇，可能形成轉錄––複製衝突，造成複製叉停滯、DNA損傷，甚至造成基因體不穩定。因此，細胞如何在基因活躍轉錄區域中維持DNA複製順利進行，是基因體穩定性研究的重要課題。

本院細生所高承福研究員的研究團隊發現，Rpd3L染色質去乙醯化複合體在轉錄–複製衝突中扮演關鍵角色。研究指出，Rpd3L可透過二種機制運作，第一種是依賴H3K4甲基化標記進行精準招募，第二種是不依賴H3K4甲基化的替代路徑。透過這兩種機制，Rpd3L能動態調整染色質的乙醯化狀態，進而影響DNA複製叉的前進速度，使其在通過活躍轉錄區域時更加穩定，避免與轉錄機器發生碰撞。

研究經費由本院深耕計畫與國科會共同支持，論文合作者包括本院細生所呂在明研究助技師、國立宜蘭大學食品科學系張舜延助理教授以及國立臺灣大學食品科技研究所羅翊禎教授。研究成果已於6月10日發表於《科學進展》(Science Advances)。