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兩側對稱動物指的是身體結構呈左右對稱的動物，如斑馬魚、線蟲、果蠅和渦蟲等。雖然其身體結構對稱，但各物種的體型呈現(body plan)差異很大，約可分為30多個動物門。本院生物多樣性研究中心助研究員駱乙君帶領的團隊分析了來自15個動物門、涵蓋54個綱的染色體層級基因體。研究利用「染色體重排指數」量化基因體結構的重排程度，發現大部分兩側對稱動物基因體呈現顯著重排現象，即基因體中DNA序列的結構發生了重大變化，包括染色體的融合、裂分與易位等。而海洋無脊椎動物如玉柱蟲、海膽、文昌魚和扇貝等基因體結構較為保守，五億年來未發生重大變化。

進一步分析顯示，基因體的高度重排與基因體大小、轉座因子或GC含量無明顯關聯，但與蛋白質序列的快速演化有顯著關聯，顯示基因體結構與基因演化的同步變化。這項研究有助於了解動物基因體結構的重排與演化適應之間的關聯，並揭示染色體結構穩定性的分子機制。本研究由本院前瞻計畫及國科會專題研究計畫支持，研究成果於2025年8月發表於《基因體生物學》(Genome Biology)期刊。