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實驗設計之理論研究與其在人工智慧上的應用

工作內容：我們實驗室的研究主題為探討植物中mRNA遠距
運輸的分子機制。主要研究項目為利用活體細胞顯微技術、
蛋白質體學及分子遺傳學技術分析參與mRNA遠距運輸的關
鍵機制。

協助本所圖書館業務進行。

研究主題：人工智慧驅動的蛋白質設計與泛素系統調控機制

中央研究院生物化學研究所 吳昆峯博士研究團隊(https://kpwulab.com/) 致力於結合人工智慧（AI）與結構生物學技術，發展自主開發的 AI 工具以解析蛋白質結構、設計新型結合體，並應用於探討 泛素（ubiquitin）系統的調控與功能機制。

近年來，本實驗室以跨領域策略結合 AI 蛋白質設計與結構生物學研究，利用大量人工智慧工具進行蛋白質設計（ACS Synthetic Biology 2023）與藥物篩選（Journal of Biological Chemistry 2025），並應用精準的 蛋白質循理性設計（Journal of Molecular Biology 2023），開發具有強效抑制功能與穩定性的設計蛋白質。


同時，我們採用多項結構生物學新穎技術，包括 冷凍電子顯微鏡（CryoEM；Protein Science 2022, Nucleic Acids Research 2023, JACS 2023）、蛋白質結晶學（JMB 2022; PDB: 7D47, 7YQN, 8JUX, 9LQK, 9LQM)，以及 AI-加速之NMR 數據收集與分析，以加速蛋白質結構與功能設計之研究進程。這些技術整合使我們能深度解析泛素系統酵素的活化機制與調控模式，建立 AI 與實驗驅動的完整研究框架。

本實驗室獲多項中研院計畫補助，包括：

深耕計畫（2026–2030）
人工智慧與蛋白質設計計畫（2025–2027）
關鍵突破種子計畫（2026–2027，協同主持人）
提供穩定的研究環境與多元的跨領域合作機會。



【主要職責】

開發與應用 AI 或機器學習方法於蛋白質結構、交互作用與功能預測
與團隊成員協作，整合計算與實驗數據以推進研究計畫
撰寫論文、協助研究計畫申請，並參與國際合作與學術交流

研究主題：蛋白質純化、結構功能研究與AI輔助分析

中央研究院生物化學研究所 吳昆峯博士研究團隊(https://kpwulab.com/) 致力於結合人工智慧（AI）與結構生物學技術，發展自主開發的 AI 工具以解析蛋白質結構、設計新型結合體，並應用於探討 泛素（ubiquitin）系統的調控與功能機制。

近年來，本實驗室以跨領域策略結合 AI 蛋白質設計與結構生物學研究，利用大量人工智慧工具進行蛋白質設計（ACS Synthetic Biology 2023）與藥物篩選（Journal of Biological Chemistry 2025），並應用精準的 蛋白質循理性設計（Journal of Molecular Biology 2023），開發具有強效抑制功能與穩定性的設計蛋白質。


同時，我們採用多項結構生物學新穎技術，包括 冷凍電子顯微鏡（CryoEM；Protein Science 2022, Nucleic Acids Research 2023, JACS 2023）、蛋白質結晶學（JMB 2022; PDB: 7D47, 7YQN, 8JUX, 9LQK, 9LQM)，以及 AI-加速之NMR 數據收集與分析，以加速蛋白質結構與功能設計之研究進程。這些技術整合使我們能深度解析泛素系統酵素的活化機制與調控模式，建立 AI 與實驗驅動的完整研究框架。

提供完善的訓練環境與跨領域學習機會，適合希望進一步發展於結構生物學、AI蛋白設計或博士進修方向的年輕研究者。



【主要職責】

執行蛋白質表現與純化（FPLC、親和／離子／膠體層析等）
進行生物物理與結構分析（ITC、DSF、CD、NMR、X-ray crystallography, cryo-EM等）
協助進行AI設計蛋白之實驗驗證與資料整合
支援研究計畫與實驗室日常運作

(1) 進行空間點過程的研究
(2) 協助研究工作，包括最少的行政文書工作

量子光電技術是未來光量子運算、量子通訊與量子感測的基礎。本研究團隊
專注於量子光電元件的技術開發。此職務的工作內容為研發高效率低雜訊的
超導奈米線單光子偵測器。

1.大樓機電等設施維護管理。
2.公務車輛管理。
3.清潔人力管理。
4.其他交辦事項。

• 整合分析環境因子暴露與植物生理反應資料及參數法
• 將生理反應參數化整合至區域或全球大氣化學模式
• 研究計畫的執行與進度管理，並協助撰寫論文與參與成果發表

口述歷史組數位資料庫建檔作業（傳統錄音帶轉數位檔，及文字說明打字建檔）。

• 使用大氣模式及觀測資料分析及繪圖
• 協助實驗室相關研究活動

實驗室簡介：
黃人則實驗室以化學生物學為核心，結合有機與胜肽合成技術，開發應用於神經退化疾病研究的功能性分子與材料。我們設計並合成具光控制或標靶特性的胜肽與小分子用於誘導或偵測蛋白質聚集; 同時發展奈米探針與胜肽水凝膠，作為藥物遞送、診斷與組織修復的平台，期望透過化學設計推動疾病研究與生醫應用的整合。

工作內容：
1. 有機化學反應與分子修飾設計。
2. 分析與確認分子結構（HPLC、LC-MS、NMR）。
3. 胜肽設計、小分子合成與修飾（固相合成、純化、結構確認）。
4. 協助開發可應用於蛋白聚集體偵測或降解的分子工具。
5. 協助計劃執行以及數據整理分析。