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(一)研究方向
本實驗室研究聚焦於神經退化性疾病、脊髓與肌肉老化，以及RNA 生物學。我們以疾病機制與分子調控為核心，結合多體學技術深入探討神經與肌肉系統在老化與病理狀態下的變化，並透過穩定且高品質的資料產出，建立長期且具延續性的研究主軸。
(二)職位說明
本職位為研究導向之生物資訊研究助理，主要負責從多體學資料中萃取具生物學意義之結果。工作內容以客製化分析與生物學詮釋為主，同時包含部分常規分析流程執行以及分析工具測試與流程優化。前期將與資深生物資訊分析師共同討論分析策略並分工執行，預期於一年內逐步培養為可獨立處理客製化分析之研究型分析師。
(三)實驗室優勢
本實驗室具備穩定且高品質之多體學資料來源，由具十年以上經驗之資深生物資訊分析師帶領，研究成果穩定發表並依實際貢獻排序作者。實驗室具有穩定研究經費支持，並與國內外研究團隊維持長期合作關係，提供成員良好的研究環境與未來深造發展優勢。

1. 協助「家庭動態調查」籌備、執行與資料清理。
2. 協助「家庭動態調查」跨期資料整合。
3. 協辦研討會、工作坊等學術活動。
4. 其他行政與臨時交辦事項。

研究主題：蛋白質純化、結構功能研究與AI輔助分析

實驗室研究主題: 蛋白質泛素化 (ubiquitination)的調節機制、泛素化相關機制之藥物開發。

實驗室獲多項中研院計畫補助，包括：

深耕計畫（2026–2030）
人工智慧與蛋白質設計計畫（2025–2027）
關鍵突破種子計畫（2026–2027，協同主持人）
提供穩定的研究環境與多元的跨領域合作機會。

工作內容
(1) AI設計之蛋白質表達與純化
(2) 蛋白質活性、物性與化性鑑定
(3) 抑制劑/藥物等功能性實驗
(4) 其他交辦事項/執行研究計畫

以上內容可依個人技術/學術背景分配工作內容，實驗室提供完整技術訓練。

泛素(ubiquitin) 與轉錄後修飾的泛素化(ubiquitination) 影響過半的細胞內蛋白質功能與降解。 我們研究蛋白質泛素化的鏈結與疾病間的複雜關係。使用結構生物學了解細微的蛋白質之間的互動，應用最新AI技術設定蛋白質與小分子藥物，我們整合多項關鍵技術並建立分析平台，加速泛素化蛋白質數據的分析

我們提供完整的教育訓練，加入本團隊可學得多種結構生物、生物物理與生物資訊分析的關鍵技術。有助於未來職場競爭或是出國進修。 近年實驗室成員進入台大等研究所、或出國攻讀博士12人。

相關資訊請參考以下兩個連結:

https://www.ibc.sinica.edu.tw/facultyV.php?type=PI&DatetimeStr=20210916145242&lang=

https://kpwulab.com

研究主題：人工智慧驅動的蛋白質設計與泛素系統調控機制

中央研究院生物化學研究所 吳昆峯博士研究團隊(https://kpwulab.com/) 致力於結合人工智慧（AI）與結構生物學技術，發展自主開發的 AI 工具以解析蛋白質結構、設計新型結合體，並應用於探討 泛素（ubiquitin）系統的調控與功能機制。

近年來，本實驗室以跨領域策略結合 AI 蛋白質設計與結構生物學研究，利用大量人工智慧工具進行蛋白質設計（ACS Synthetic Biology 2023, JACS 2026）與藥物篩選（Journal of Biological Chemistry 2025），並應用精準的 蛋白質循理性設計（Journal of Molecular Biology 2023），開發具有強效抑制功能與穩定性的設計蛋白質。


同時，我們採用多項結構生物學新穎技術，包括 冷凍電子顯微鏡、蛋白質結晶學，以及 AI-加速之NMR 數據收集與分析，以加速蛋白質結構與功能設計之研究進程。這些技術整合使我們能深度解析泛素系統酵素的活化機制與調控模式，建立 AI 與實驗驅動的完整研究框架。

本實驗室獲多項中研院計畫補助，包括：

深耕計畫（2026–2030）
人工智慧與蛋白質設計計畫（2025–2027）
關鍵突破種子計畫（2026–2027，協同主持人）
提供穩定的研究環境與多元的跨領域合作機會。



【主要職責】

開發與應用 AI 或機器學習方法於蛋白質結構、交互作用與功能預測
與團隊成員協作，整合計算與實驗數據以推進研究計畫
撰寫論文、協助研究計畫申請，並參與國際合作與學術交流

培養新世紀資料科學與智慧醫療人才

計畫介紹：結合資料科學與人工智慧，並與生物醫學與智慧醫療領域的專家密切合作，以科學化方法將數據轉化成知識並產品落地。

工作內容：資料科學與人工智慧之智慧醫療研究與應用
(1) 學習各式大數據與分析（各式體學、醫療影像、文字探勘、行為環境、人體生物資料庫等）
(2) 程式撰寫與軟體系統開發
(3) 生物資料庫之資訊探勘與建置

參考網站：http://sites.stat.sinica.edu.tw/SH/ & https://www.stat.sinica.edu.tw/hsinchou/

利用統計、機器學習、與深度學習，解析國內外大型資料庫資訊，並與醫學中心跨領域專家密切合作，實際應用於精準醫療與智慧健康，創造資料價值。

(1) 巨量資料分析（基因體等各式體學、行為環境、電子病歷、文字資料、人體生物資料庫等）
(2) 醫學影像分析、電腦視覺處理、生醫訊號處理
(3) 統計方法、理論與軟體研發、資訊系統及產品開發

參考網站：
(1) https://sites.stat.sinica.edu.tw/SH/
(2) https://sites.stat.sinica.edu.tw/SARS-CoV-2/
(3) http://gap.stat.sinica.edu.tw/
(4) https://www.stat.sinica.edu.tw/hsinchou/

徵求有志從事跨領域生醫/神經科學研究的新成員，與我們一起解構神經傳導的細胞及分子網絡。

我們結合生物工程、蛋白質設計、化學、以及神經科學的概念與技術，已開發一系列光遺傳學 (optogenetics) 及光藥理學 (photopharmacology) 工具。目前正建立生物測試系統，將運用新工具精準調控或探測複雜的神經傳導現象。

我們徵求對【運用光遺傳技術探討神經系統與癌細胞或周邊組織的交互作用】有高度熱誠、且具備基本知識及實作經驗者，與我們一同挑戰這個跨領域的新課題。

我們的研究領域涵蓋計算生物學，資料科學與機器學習。研究題目包含：癌症基因體之資料整合，對異質性腫瘤之治療策略，單細胞基因體資料分析，人類族群生物網路之演化，網路拓璞分析，及以深度神經網路進行非監督式學習等。團隊成員將會學到特定領域知識，科學推理，建立並解數學模型，開發演算法，撰寫程式，收集並分析大數據，且與團隊成員與合作者密切合作。我們希望找到對科學研究與解決新問題具有熱忱並願意投入時間與精力的成員。

徵求對神經生物學研究有興趣熱誠之碩士級助理及博士後研究員。
程老師長期研究神經生物學。現徵求對用老鼠做基礎神經生物研究有興趣的助理以及研究人才。

協助實驗室儀器組裝測試、機械製圖、出海實驗

1. 協助心智科學腦電(磁)波、腦影像研究計畫執行，紀錄與分析功能性磁振造影、腦電(磁)波資料。
2. 協助實驗室行政事務與臨時交辦事項。
3. 需有動機與能力主動學習實驗之紀錄執行及腦電(磁)波、腦影像訊號分析處理等相關技術。
4. 需參與實驗室之研究討論與閱讀文獻。

高通量次世代序技術為生物學領域中與基因體學相關研究的各種問題提供了開創性工具，涵蓋二代NGS到三代TGS重要平台，包括Illumina、PacBio、Oxford Nanopore，及最新的Aviti24。為基因體組裝/變異、疾病/病原菌、種群調查、演化和基因組編輯等提供了許多不同的應用，在大小不同的純基因體或是metagenome, transcriptome, 3D Genome, Single-cell/Spatial profiling等都經驗豐富。
我們擅長開發新型的應用，並藉由不同定序平台及互補優點，提供各式常規建庫、基因組遠距跨接、以及近年建立的10x Genommics單細胞和組織空間轉錄體學等等，滿足各種NGS科研的需求及新方法。我們的工作提供了NGS實驗設計、樣品處理建庫，以及不斷發展的測序技術，並能從中累積NGS資料，並有許多training workshop 和參加研討會的機會，參予各式平台技術生物資訊的分析互動並拓展相關的能力。
*本團隊注重紮實的實驗能力、資料庫使用維護和科學邏輯，並鼓勵好奇心與新穎應用開發，提供二代和三代高通量定序平台的完整訓練及交互運用，和不同面像的表達溝通能力。實驗室的合作計畫包括模式/非模式物種基因體、病原菌、遺傳疾病、腸道菌相、傳染病研究等。

【實驗助理-工作內容】
高通量定序相關實驗 (DNA/RNA之樣品純化、QC與判讀，library製備/優化和新protocol開發，操作並維護高速定序儀/raw data產出)，並協助研究室行政事務之彙辦 (如藥品管理)等。

【生物資訊助理-工作內容】
1. 基因體和NGS定序資料的分析及流程建立和優化、程式撰寫
2. 資料庫/伺服器維護管理、系統建置維護、實驗室網頁及網路管理
3. 巨量資料備份和管理