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實驗室目前的核心研究聚焦於自然環境中的酵母菌，特別是以多物種（multi-species）、多族群（multi-population）的架構，結合族群基因體學、多體學與自動化表型分析，探索酵母在自然界中的演化、適應與生態分化。

現行多數族群基因體學研究多集中於單一物種；然而，若要真正理解演化過程中的共通規律與物種差異，必須將多個酵母物種、各自多個族群，放在相同地理與環境背景下進行比較。我們希望建立這樣一個具比較深度與解析力的研究架構，去回答更基本、也更困難的演化問題。

目前實驗室結合野外採樣、基因體定序、自動化表型分析與多體學整合，已累積超過 3000 株酵母菌株，並持續建立亞洲尺度的 yeast evolutionary genomics 資源。

我們想回答的問題：
1. 台灣對酵母菌而言，扮演的是什麼樣的演化角色？
2. 不同酵母物種在相似環境下，是否會出現平行演化？
3. 自然選擇主要作用在基因體、轉錄體，還是代謝層級？
4. 不同酵母物種之間的適應模式，哪些是共通的，哪些是各自獨特的？
5. 多物種、多體學與表型資料能否一起幫助我們更準確理解自然界中的演化機制？

研究技術與資源
實驗室研究結合：
• 野外酵母採樣與菌株分離
• 基因體定序與族群基因體分析
• 自動化高通量表型分析
• transcriptomics、metabolomics 等多體學整合
• 長讀定序與生物資訊分析

我們希望把酵母研究從單一物種、單一尺度的分析，推向多物種、多層次整合的比較框架。

我們期待你：
• 對自然界中的酵母演化有真正的好奇心
• 願意學習新技術，也願意跨尺度整合不同資料
• 具良好溝通能力，樂於討論與合作
• 對研究紀錄、資料整理與分析保持嚴謹
• 具基因體學、生物資訊、微生物培養、分生實驗、表型分析或多體學相關經驗者佳，但非必須

協助實驗室儀器組裝測試、機械製圖、出海實驗

(1)協助統計與數據科學方法之發展，包含程式撰寫、模擬分析、使用Linux PC cluster、文獻蒐集、LaTeX 文件撰寫及統計軟體開發等。
(2)協助處理生物醫學、臨床試驗及穿戴式裝置等研究所產生之資料。
(3)協助研究相關行政事務。

本研究計畫旨在探討植物中轉錄因子在多樣細胞分化過程中的功能與演化。我們正在尋找一位具備熱忱與主動性的夥伴，參與以下實驗工作，包括模式植物 Arabidopsis thaliana（阿拉伯芥）栽培、植物轉殖、以顯微鏡為基礎的分析，以及利用 Nicotiana benthamiana（本氏菸草）進行暫時性報導基因分析。
應徵者亦需進行基本資料分析工作，包括轉錄體分析及單細胞 RNA 定序（single-cell RNA-seq）分析，並使用 Excel 等工具處理資料。不要求具備上述研究領域的相關經驗。我們期待應徵者樂於學習新技術、能與實驗室成員積極溝通，並具備獨立推動研究進展的能力。

1. 負責檢體名單之維護與更新
2. 優化現行作業流程，協助導入自動化機制
3. 負責 DNA 檢體儲存設備（低溫冰箱及系統）之管理及操作
4. 協助辦理資料運用推廣及教育訓練活動
5. 協助組內行政作業及跨組支援事項，包括流程規劃、資料整理及查詢回應等業務

協助執行國科會「臺灣數位世代青少年的成長歷程追蹤研究(4/5)」計畫案。

1.協助大型調查資料與統計數據之整理與統計分析。
2.協助特定研究主題中英文文獻收集與摘要寫作。
3.參與定期的研究會議，管理與整理研究檔案與數據資料庫。
4.協助其他研究行政工作與交辦事宜。

研究室目前主要進行生態系統服務（Ecosystem Services）評估相關研究，歡迎對此領域有興趣的夥伴加入研究團隊！
1. 蒐集生態系統服務資料，進行空間分析及建模
2. 生態系統服務貨幣化估算

(1)實驗室化學分析及樣本前處理。
(2)資料處理、支援實驗室其他研究與觀測活動及計畫臨時交辦事項。

(1)處理環境及健康資料，或以GIS進行氣象、人口社經及空氣品質資料分析。
(2)支援實驗室其他相關研究活動及計畫臨時交辦事項。

氣候資料處理及繪圖（氣候議題研究）

1. 資料探勘與深度學習/大語言模型、多媒體社群網路與通訊網路、應用數學應用相關研究。
2. 或者具備演算法設計、圖論、最佳化、賽局理論、機器學習、深度學習、統計推論、隨機程序相關背景愛好數學。
3. 實作深度學習模型、大型語言模型等，收集資料集並進行以上模型實驗。
4. 或者有興趣網路或巨量資料分析系統實作、程式撰寫適合擬專心研究論文撰寫，未來從事學術工作者。

協助蒐集與整理研究計畫相關資料、校稿，演講、學術座談會舉辦、臨時交辦事項等