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生物化學研究所

博士後研究員

博士後研究學者

研究主題：新穎蛋白質設計調控泛素系統

實驗室簡介

中央研究院生物化學研究所 吳昆峯博士研究團隊（https://kpwulab.com/）以「蛋白質化學」為核心，研究泛素（ubiquitin）與泛素類似修飾（UBL）系統的活化、調控與功能機制，研究對象包括 E3 連接酶、去泛素酶（DUB）等泛素化修飾系統。泛素與泛素類似修飾系統的酵素本身即為近年最受關注的藥物標的家族之一。

本實驗室的研究架構建立在「計算設計—實驗驗證」的完整循環之上。AI 工具可在短時間內產生大量候選分子，但其價值必須經由蛋白質表現與純化、生物物理定量、生化重組反應與結構解析逐一檢證。計算設計平台於本實驗室已臻成熟，本次招募之職位將主導實驗驗證端，為決定研究品質與推進速度的關鍵角色。本實驗室所開發之設計蛋白質，除作為解析酵素活化與調控機制的分子工具外，亦具備發展為專一性抑制劑或標的蛋白降解劑（targeted protein degradation）之潛力。經生化重組與結構層次完整驗證的分子，將進一步與細胞生物學實驗室合作，推進至細胞模式與疾病模式之功能驗證。本職位所產出的分子與數據，即為銜接分子設計與轉譯應用的起點。

跨團隊合作

本職位並非單點的技術執行，而是跨越多個團隊的樞紐角色。分子產出與實驗數據將同時對接：
●計算設計團隊——回饋親和力、專一性與結構資訊，驅動下一輪設計迭代
●結構解析平台——冷凍電鏡、蛋白質結晶學與 NMR 之數據收集與結構解析
●細胞生物學合作團隊——將經生化與結構驗證之分子導入細胞系統，檢驗其對泛素化修飾與下游訊息路徑之調控效果，並進一步延伸至疾病相關模式
●國內外學術合作單位——共同推動方法開發與轉譯應用


我們期望每一個設計分子的驗證能貫穿「分子設計—生化重組—結構解析—細胞功能—疾病調控」的完整鏈條，而本職位正位於此一鏈條的核心。

研究環境

實驗平台包括冷凍電子顯微鏡、蛋白質結晶學、AI 加速之 NMR 數據收集與分析、HDX-MS、ITC/BLI，以及酵母菌表面呈現（yeast surface display, YSD）篩選與親和力成熟平台。近年成果發表於 ACS Synthetic Biology（2023）、JACS（2026）、Journal of Biological Chemistry（2025）、Journal of Molecular Biology（2023）與 Protein Science（2026）。

本實驗室獲多項中研院計畫補助，包括深耕計畫（2026–2030）、人工智慧與蛋白質設計計畫（2025–2027）、關鍵突破種子計畫（2026–2027，協同主持人），提供穩定的研究環境與多元的跨領域合作機會。

主要職責
●蛋白質表現與純化（大腸桿菌／哺乳類細胞系統），建立穩定可重複、可交接的純化流程
●以生物物理與生化方法（ITC、BLI、SEC-MALS、酵素動力學等）分析蛋白質性質與蛋白質—蛋白質交互作用
●以冷凍電鏡、X 光晶體繞射或溶液態 NMR 解析目標蛋白與複合體結構
●執行 YSD 文庫建構、FACS 篩選與親和力成熟，驗證並優化 AI 設計之結合體
●將實驗數據回饋至設計循環，與計算設計團隊協作優化下一輪分子
●與細胞生物學合作團隊共同規劃並執行細胞層級之功能驗證，將分子推進至疾病相關模式
●撰寫論文、協助研究計畫申請，並參與國內外合作與學術交流

●博士學位（生物化學、結構生物學、蛋白質科學、生物物理或相關領域）
●具備紮實且能獨立作業的蛋白質表現與純化實作經驗：層析操作、品質管控
●熟悉至少一項定量生物物理或酵素學方法（ITC、BLI、SEC-MALS、酵素動力學等），能自行設計實驗、判讀數據品質
●具備至少一項結構解析方法之實際操作經驗（冷凍電鏡、蛋白質結晶學或 NMR），能獨立完成資料收集與結構建模
●具獨立研究思考能力、責任感與團隊協作精神，樂於在跨領域環境中溝通合作

具備下列條件者優先

●泛素／UBL 系統之生化研究經驗
●具細胞層次功能驗證經驗，或具高度意願學習並將設計分子推進至疾病相關模式者
●酵母菌表面呈現（YSD）文庫篩選經驗，熟悉 FACS 操作
●曾以實驗方法驗證計算或 AI 設計之蛋白質（binder、miniprotein、de novo design）

說明

本職缺以實驗操作為主軸，不要求 AI 模型開發或程式設計能力，亦不需具備機器學習背景。惟需能與合作團隊有效溝通、理解設計邏輯，並樂於以實驗結果驅動設計循環的迭代。

本職位無需獨力涵蓋上述所有環節；實驗室已建立各環節之合作管道與技術支援，重點在於能主導分子的生化與結構驗證，並有效串接前後端團隊。

依中研院規定

中央研究院生物化學研究所

中央研究院生物化學研究所（台北南港） 薪資從64711 起聘，依中央研究院及規定，並視經驗調整，表現良好可彈性調薪。 本職缺適用「勞動基準法」，可依經歷調薪或彈性敘薪，享勞健保及1.5月年終獎金。 可入職時間: 隨時可入職

吳昆峯老師

台北市南港區研究院路二段128號 中研院 生化所

02-2785-5696

【申請資料】

●個人履歷（含學經歷、研究摘要、發表論文列表）
●三位推薦人之聯絡方式（姓名、職稱、E-mail）

申請請寄至： kpwulab@gmail.com，請於信件主題註明 [應徵博士後研究員/Postdoc]

備註： 資格不符者，將主動移除信件，恕不退還申請資料。

2026-08-03

2026-11-03