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• 智財技轉處：權益收入之收取、分配、通知、轉讓過戶等相關事宜。
• 總務處：權益收入之保管、列帳（含支票存入）、出納及其他國有財產管理等相關事宜。
• 主計室：權益收入會計相關事宜。
• 創作人代表：全體創作人權益收入之分配事宜。如權益收入涉及多項技術，則由各創作人代表共同協調分配事宜。
• 創作人所屬單位：
  
  • 創作人及其所屬實驗室權益收入之給付。
  • 衍生稅款及規費之計算與繳納。
  • 開立扣繳憑單及其他相關事宜。

• 收取及列管：智財技轉處收到權益收入匯入本院現金帳戶之通知，應確認金額是否符合契約規定。如收到權益收入為支票，應於點收後移請總務處辦理支票存入、列帳及出納相關事宜，並請主計室辦理會計相關事宜。
• 分配：智財技轉處依據第四點第二項辦理簽報事宜，簽准後，函知創作人代表、創作人所屬單位及主計室。
• 給付：創作人所屬單位收到智財技轉處分配函後，依稅法及全民健康保險之相關規定，於期限內處理代扣稅款、補充健保費等相關事宜，且於法定期限內開立扣繳憑單予創作人。
• 繳納國庫或資助機關：
  
  • 國庫：智財技轉處每季彙整繳交金額，將明細表及匯款資料函知行政院國家科學技術發展基金管理會。
  • 資助機關：智財技轉處申請匯款或檢附總務處開立之支票，依各資助機關之規定辦理繳交及通知作業。另每季彙整繳交金額等相關資料進行控管。

• 創作人應自行負擔證券交易稅。
• 創作人所屬單位負擔包含股票分割費用、股票印製費用、補充健保費等相關費用。

創作人所屬單位負擔前項費用，其現金不足支應之差額，暫由院方墊付，俟股權處分取得現金時，扣除前述代墊之差額後，再進行分配予創作人所屬單位。

• 收取及列管：智財技轉處收取股權，應點收並移請總務處保管及列帳，並請主計室辦理股權會計相關事宜。
• 分配：智財技轉處依第四點第二項辦理創作人、國庫或資助機關之股權分配事宜，簽准後，連同每股過戶轉讓價格等相關資料函知創作人代表及創作人所屬單位，並副知主計室。
• 轉讓過戶：
  
  • 智財技轉處辦理事項：
    
    • 通知各創作人受分配股數、應繳納證交稅金額並向創作人收取轉讓過戶相關文件辦理用印事宜。
    • 過戶股權予創作人後，將過戶完成之股權相關資料函知創作人及創作人所屬單位。
    • 函送轉讓過戶相關文件至國庫或資助機關辦理用印事宜。
    • 過戶股權轉讓予國庫或資助機關後，將過戶完成之股權相關資料函知國庫或資助機關。
  • 創作人所屬單位辦理事項：
    
    • 收到智財技轉處轉讓過戶函後，將證券交易稅收據之出賣人收據聯留存記帳，代徵人收執聯及股票交付創作人留存。
    • 創作人所屬單位依稅法及全民健康保險之相關規定，於期限內繳納代扣稅款、補充健保費，並於法定期限內開立扣繳憑單予創作人。

股權以一次分配為原則，如本院與創作人另有約定，得依約定辦理分次分配。