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本院自1996年起開始頒授「年輕學者研究著作獎」以鼓勵年輕學者深入思考，發表優秀學術著作。獎項設立以來，其激勵與啟發效用，甚獲國內學術界重視。今年「年輕學者研究著作獎」頒獎典禮於2012年6月5日(星期二)在本院資訊科學研究所一樓會議室隆重舉行，由翁啟惠院長主持。獲獎者親屬亦獲邀出席，分享榮耀與喜悅。

今年共計15位得獎者，每位獲頒獎金新台幣20萬元、研究獎助費新台幣30萬元，以及獎牌一面。頒獎典禮每位獲獎人並以3分鐘簡介其著作。

本屆年輕學者研究著作獎共有166件申請案：數理組75件、生命組39件、人文組52件。申請案件皆經過各分組預審、初審、複審程序，再送三組聯席審查委員會討論，始決議得獎名單。

今年獲獎年輕學者名單如后。

數理科學組（5人）：
        范士岡（國立交通大學材料科學與工程系副教授）
        郭哲來（中央研究院原子與分子科學研究所副研究員）
        李瑞光（國立清華大學光電工程研究所副教授）
        張孟凡（國立清華大學電機工程學系副教授）
        李超煌（中央研究院應用科學研究中心研究員/ 國立陽明大學生醫光電研究所教授）

生命科學組（5人）：
        王學偉（國立陽明大學微生物及免疫學研究所教授）
        王昭雯（中央研究院植物暨微生物學研究所副研究員）
        詹迺立（國立臺灣大學醫學院生物化學暨分子生物學研究所副教授）
        吳宗益（中央研究院基因體研究中心副研究員）
        楊宗霖（國立臺灣大學醫學院耳鼻喉科助教授）

人文及社會科學組（5人）：
        林宏明（國立政治大學中國文學系副教授）
        吳  嫻（國立中央大學認知神經科學研究所副教授）
        張文貞（國立臺灣大學法律學院副教授） 
        李佩容（國立東華大學民族語言與傳播學系助教授）
        蔡政宏（東吳大學哲學系副教授）