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連續13年，本院為鼓勵年輕學者深入思考，特別設置「年輕學者研究著作獎」，鼓勵年輕學者發表優秀學術著作。目前專門頒發給年輕學者的研究鼓勵獎項不多，本院此獎項已經發揮鼓勵年輕學者之功能，深具學術意義。

今年本院於97年6月9日(星期一)為16位獲獎優秀學者，舉辦一場簡單隆重的頒獎典禮，典禮由翁啟惠院長主持。每位得獎者於典禮中各以3分鐘簡介其著作，同時每人獲頒獎金新台幣20萬元、研究獎助費新台幣30萬元，以及獎牌乙面。

本屆共有169件申請年輕學者研究著作獎，分別為數理組66人、生命組36人、人文組67人。經過預審、初審、複審後，再由數理科學組、生命科學組、人文社會科學組三組審查委員聯席會討論後，始決議選出得獎者。

今年獲獎年輕學者名單如后。
數理組（8人）：
王道維副教授 (清華大學物理系)
邱鴻麟助理教授 (中央大學數學系)
林建宏助理研究教授(成功大學電漿與太空科學中心)
陳方中助理教授(交通大學光電系)
陳振中副教授(台灣大學化學系)
陸曉峰副教授(中正大學通訊工程學系)
蔡易州助理教授(清華大學化學系)
陳玉如副研究員(中央研究院化學研究所；數理組跨生命組)

生命組(4人)：
吳素幸助研究員(中央研究院植物暨微生物學研究所)
吳漢忠副研究員(中央研究院細胞與個體生物學研究所)
周祖述副教授（台灣大學醫學院臨床醫學研究所）
鄭文芳副教授（台灣大學醫學院臨床醫學研究所）

人文組(4人)：
陳正國助研究員(中央研究院歷史語言研究所)
陳旭昇副教授(台灣大學經濟系)
黃慧娟副教授(清華大學語言學研究所)
梁孟玉助研究員(中央研究院經濟研究所)