化學研究所為中央研究院最早設立的數個研究所之一，於民國十七年成立於上海。二次世界大戰期間，化學所雖在重重艱難中，幾經遷徙，但仍堅守學術研究使命，繼續成長。民國三十八年中央研究院遷臺，並於四十三年在南港現址營建院區，化學研究所於四十六年正式在臺復所。之後幾年，該所逐步在純化學及應用化學的範疇裡奠立起研究的根基。自民國七十年起，在本院的三個五年發展計畫下，該所得以擁有較寬裕的研究經費，延攬優秀研究人員，添置精密儀器設備，積極擴充成長，並興建一棟現代化之五層樓錢思亮館及另一棟八層高之研究大樓。

研究方向

　　化學所在二十一世紀裡將扮演引領尖端研究的重要角色。現階段所內研究領域涵蓋化學之各重點學門，包括跨學科之研究，並特別著重於三個方向：化學生物、材料化學暨奈米科技、以及觸媒化學。化學生物領域主要研究小分子－生物大分子交互作用、蛋白質摺疊、碳水化合物化學、以及生物催化反應。在材料化學暨奈米科學方面，液晶、有機發光二極體、表面化學及自動組裝現象、分子電子學暨分子機械等為研究主軸。而觸媒化學研究則著重於異相與均相催化作用、以及應用有機金屬化學之模型研究。

人員與設備

　　化學所現有專任研究人員24人，合聘研究員7人，行政技術支援人力20人，以及約130多名協助研究之博士後研究學者與助理。此外，與大學合作指導之研究生約有75人。所內擁有許多先進儀器設備，包括核磁共振儀、掃瞄式電子顯微鏡、原子力顯微鏡、X光繞射儀、各式質譜儀、電子順磁共振光譜儀、光電子能譜及歐傑電子能譜儀、非線性光學光譜儀、圓二色旋光儀、以及各式熱分析儀等精密儀器以供研究所需。

　　圖書館藏書近24,000冊，並訂有國際學術期刊115種及全套化學摘要。此外，配合STN線上資料庫、Beilstein/Gmelin化學資料庫等查詢系統及90多種電子期刊全文資料庫，為化學研究者提供了快速完整的資料。所內亦可由個人電腦及工作站透過完善的網路設施，連結院區計算中心及國家高速電腦中心之計算資源，以滿足研究需求。

重要研究成果

　　化學所每年約有超過100篇論文發表於國際重要期刊，並獲得多項專利。該所強調學術研究與應用科學並重，在數個尖端領域中有傑出表現，所內同仁曾獲得許多獎項及榮譽。