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GlycoSHIELD—量化描述蛋白質醣衣的遮蔽效應與生物意義
發布時間: 2024-03-05
細胞和病毒表面的蛋白質往往包覆著一層厚厚的醣衣，其對病毒辨識宿主和免疫防護有很大貢獻。完整描述醣蛋白的結構與動態需要大量計算資源，為解決此問題，本院生物化學研究所徐尚德研究員實驗室結合低溫電子顯微鏡（cryo-EM）、質譜、小角 X 光散射（SAXS），提供關鍵實驗，驗證德國馬克斯·普朗克生物物理學研究所（Max Planck Institute for Biophysics）Mateusz Sikora博士與巴黎西岱大學（Université Paris-Cité）Cyril Hanus博士合作團隊透過分子動態模擬分子動力學（Molecular Dynamics）所開發的演算法。經過多次交叉比對驗證理論實驗結果後，成功建立 GlycoSHIELD。該計算流程可使用個人電腦迅速建立完整的醣蛋白之3D立體模型，協助研究人員分析醣分子在蛋白質表面的空間分布、屏蔽效應，以及預測醣分子對生物功能與蛋白質結構的影響。研究成果已於2024年2月29日發表於《細胞》（Cell）期刊。
