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每年秋天本院舉辦的「院區開放參觀活動」，12年來不論在活動項目的質與量，以及民眾參與的人數，皆逐年增長。近年來，更屢創單日4萬餘人次參與的紀錄。許多高中、國中小學校師生組團前來，激發年輕學生探索人文與自然科學的無窮興趣。

今年「98年院區開放參觀活動」訂於98年10月31日(週六)上午9時至下午4時舉行，本院共精心規劃200餘項知性與感性活動，敬邀各界蒞臨指教。

其中，3項特別活動包括：黃鍔院士主講「全球氣候變遷」、夾子電動大樂隊演出「樓•爬梯」音樂會、以及為紀念莫拉克颱風災民，用空間資訊處理技術以及災後航照影像，追溯災區村落發展的軌跡，並展示「影像紀錄中的災區今昔」。

歷年極受歡迎的科普演講活動，今年共有35場次，包括：台北城與陽明火山的故事、中草藥科學化、古文字秘密、奈米鑽石、轉殖鼠的重要、X光生醫影像與奈米醫學、分子電子學、日記與台灣史、女天文學家的貢獻、秋海棠等等。

至於，45個開放參觀的園區與實驗室中，以新近完工首度開放的「森林生態研究園區」最受民眾期待。歷年來甚受小朋友歡迎的生態實驗池、基因突變鼠核心實驗室、地震與煙霧體驗車、動物標本館、植物標本館等，預計也都將持續歷年的超高人氣參與率。而接近世界尖端科技的網格資料中心、蛋白質X光繞射儀、超高速藥物篩選儀(Uhts)、轉殖植物核心實驗室等，則最吸引高中以上學生駐足參觀聆聽。

38項親身操作或製作的現場活動，則包括分子帶動唱、漢代畫像拓印、陶器拼拼看、甲骨大繪串、國寶拼圖等等。最後，如果完成「學習單」填答與「紀念章戳」集章，還有機會獲贈本院限量的紀念獎品。