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| 院長室 President's Office |
2789-9404 | 2785-3852 |
陳副院長辦公室 Vice President Chan's Office |
2789-9405 | 2783-9824 |
| 朱副院長辦公室 Vice President Chu's Office |
2789-9401 | |
| 總辦事處 Central Administration Office |
2789-9487 | 2788-2643 |
| 數學研究所 Institute of Mathematics |
2785-1211 | 2782-7432 |
| 物理研究所 Institute of Physics |
2789-9680 | 2783-4187 |
| 化學研究所 Institute of Chemistry |
2789-9785 | 2783-1237 |
| 地球科學研究所 Institute of Earth Science |
2783-9910 | 2783-9871 |
| 資訊科學研究所 Institute of Information Science |
2788-3799 | 2782-4814 |
| 統計科學研究所 Institute of Statistical Science |
2783-5611 | 2783-1523 |
| 原子與分子科學研究所籌備處 Institute of Atomic and Molecular Sciences, Preparatory Office |
2362-0212 | 2362-0200 |
| 天文及天文物理研究所籌備處 Institute of Astronomy and Astrophysics, Preparatory Office |
2652-2200 | 2788-1106 |
| 應用科學及工程研究所籌備處 Insitute of Applied Science and Engineering Research,Preparatory Office |
2782-6670 | 2782-6680 |
| 植物研究所 Institute of Botany |
2789-9590~9 | 2782-7954 |
| 動物研究所 Institute of Zoology |
2789-9500 | 2785-8059 |
| 生物化學研究所 Institute of Biological Chemistry |
2362-0261 | 2363-5038 |
| 分子生物研究所 Institute of Molecular Biology |
2789-9222 | 2782-6085 |
| 生物醫學科學研究所 Institute of Biomedical Sciences |
2789-9000 | 2782-5573 |
| 生物農業科學研究所籌備處 Institute of BioAgricultural Science, Preparatory Office |
2651-5910 | 2651-5600 |
| 歷史語言研究所 Institute of History and Philology |
2782-9555 | 2786-8834 |
| 民族學研究所 Institute of Ethnology |
2789-9300 | 2785-5836 |
| 近代史研究所 Institute of Modern History |
2782-4166 | 2789-8204 |
| 經濟研究所 Institute of Economics |
2782-2791 | 2785-3946 |
| 歐美研究所 Institute of European and American Studies |
2789-9390 | 2785-1787 |
| 中山人文社會科學研究所 Sun Yat-Sen Institute for Social Sciences and Philosophy |
2789-8107 | 2785-4160 |
| 社會學研究所 Institute of Sociology |
2652-3399 | 2651-0415 |
| 中國文哲研究所籌備處 Institute of Chinese Literature and Philosophy, Preparatory Office |
2789-9743~4 | 2788-3132 |
| 台灣史研究所籌備處 Institute of Taiwan History, Preparatory Office |
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| 語言學研究所籌備處 Institute of Linguistics,Preparatory Office |
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| 調查研究工作室 Office of Survey Research |
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