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民國八十三年七月，本院院士會議建議在各個社會科學領域成立單一學科的研究所。八十八年十月本院成立「政治學研究所規劃委員會」。九十年九月成立「設所學術諮詢小組」，並提出設所規劃案。該案經院務會議與評議會通過後，報請總統府同意，而於九十一年三月獲准成立政治學研究所籌備處，並成立籌備處之學術諮詢委員會。現任籌備處主任為吳玉山先生，諮詢委員會召集人為胡佛院士。

設置理由

　　設置政治學研究所籌備處的主要考慮有三。第一，政治學為社會科學的基礎學門之一，站在發展本院社會科學的角度，應設立專門的研究部門。第二，政治學研究所籌備處的成立可以配合國內政治與兩岸關係快速發展的迫切需求。第三，籌備處可以更好地整合本院現有的相關資源，深化在政治學領域的研究。

研究方向

本院成立政治所籌備處的宗旨有四：

一、為國內政治學在基礎理論厚植根基，以上游之研究為重點；

二、引導國內政治學界開拓具有國際競爭優勢的研究領域；

三、結合華人社會與東亞地區之政治學術社群，建構區域學術合作網絡，開拓具有時代性與前沿性之研究議題；

四、提升對於國內政治議題研究的品質，以適切配合國家的需求；特別是促進民主政治的健全發展與提升國內政治議題公共論述的品質。

　　基於上述宗旨，政治所籌備處的任務，在於為國內政治學界界定前瞻性的目標與前景，帶領政治學社群朝向該目標努力邁進，開拓具有本國特色的研究議題，並在重點領域尋求突破並樹立國際學術地位。同時，政治所籌備處將致力於開拓與國際第一流的政治學研究機構的學術交流與合作，尤其將強化與東亞地區和其他新興民主國家政治學者的合作關係，以推動各種跨國研究合作計畫。再者，政治所籌備處將秉持知識分子對於社會的人文關懷，針對政治價值的重建、民主品質的提升等重大公共福祉議題，發揮諮詢與評議的角色。

研究群與重點議題領域

　　在上述考慮之下，政治所籌備處將重點延攬五大領域的研究人才：

一、方法論

二、政治思想與理論

三、比較政治與台灣政治

四、經驗政治

五、兩岸關係與國際關係

　　此五大領域的研究人才將組成五個研究群，作為該處的基本人力骨架，並在此五大領域範圍內全力開展七項重點研究議題領域：

一、政治學研究途徑與研究方法

二、中西政治觀念比較與規範性民主理論

三、比較民主轉型、民主鞏固與新興民主國家的政治經濟學

四、東亞政治價值體系變遷

五、選舉行為與政治參與

六、中國大陸政治經濟變遷

七、兩岸關係的理論研究